Boja očiju potiče od pigmenta u dužici. Zavisno od toga koliko u njoj ima melanina, boja dužice kreće se od svetloplave do tamnobraon. Plavi ljudi stvaraju veoma malo melanina. Zato njihova jedva obojena dužica zbog odbijanja svetlosti izgleda plavo. S povećanjem količine melanina boja se kreće ka zelenkastim, svetlobraon i tamnobraon očima.

Boju očiju određuje više gena. Kako se oni tačno ispoljavaju, još se ne zna sasvim. Obično geni za zelene i braon oči nadjačaju gene za plave oči. Većina ljudi ima braon oči. Najviše plavookih ljudi živi u severnoj Evropi.

Kod oko četvoro na milion ljudi oči su različite boje. Takva heterohromija može biti uslovljena genetski ili je posledica bolesti.